區別一、科屬不同
大麗花為植物界、被子植物門、雙子葉植物綱、合瓣花亞綱、桔梗目、菊科、管狀花亞科、向日葵族、大麗花屬多年生草本植物；芍藥為植物界、被子植物門、雙子葉植物綱、五椏果目、芍藥科、芍藥亞科、芍藥屬多年生草本植物。
區別二、形態不同
大麗花有巨大棒狀塊根，莖直立，多分枝，高1.5-2米，葉1-3回羽狀全裂，頭狀花序大，有長花序梗，常下垂，瘦果長圓形，花期6月-12月，果期9月-10月；芍藥塊根由根頸下方生出，肉質，粗壯，呈紡錘形或長柱形，芽叢生在根頸上，莖由根部簇生，高約50～110厘米，花一般獨開在莖的頂端或近頂端葉腋處，蓇葖果呈紡錘形、橢圓形、瓶形等，種子黑色或黑褐色，大型，呈圓形、長圓形或尖圓形，花期5～6月。
區別三、分布不同
大麗花別稱大理花、天竺牡丹、東洋菊、大麗菊、西番蓮、地瓜花等，原產墨西哥，是全世界栽培最廣的觀賞植物，20世紀初引入中國，現在多個省區均有栽培；芍藥別稱將離、離草、婪尾春、余容、犁食、沒骨花、黑牽夷、紅藥等，中國分布于江蘇、東北、華北、陜西及甘肅南部，東北分布于海拔480-700米的山坡草地及林下，其它各省分布于海拔1000-2300米的山坡草地，朝鮮、日本、蒙古及西伯利亞地區也有分布。
區別四、功效不同
大麗花味辛、甘，性平，歸肝經，具有活血散瘀的功效，主治跌打損傷等癥；芍藥味苦、酸，性微寒，歸肝、脾經，具有養血斂陰、柔肝止痛、平抑肝陽的功效，用于月經不調、崩漏、虛汗、脘腹急痛、脅肋疼痛、四肢攣痛、頭痛眩暈等癥。
